Estimada FlauCarmen: el método más simple consiste en 'pegar' las imágenes escaneadas (JPG, BMP u cualquier formato) en un Power Point, previamente configurado para páginas verticales, ajustando bien las dimensiones de la partitura al espacio en blanco del Power Point.
Hay programas en Internet como el PDFCreator, que tengo en mi PC, que permiten crear un PDF cuando pides la opción Imprimir, en este caso de Power Point y te hace el documento completo.
Casi todos los sistemas PDF que he visto funcionan así.
Si no puedes hacerlo, envíame las imágenes y yo te hago el PDF (miraré para otro lado cuando lo haga

).